ChessPro online

Хроники коронавируса

вернуться в форум

30.09.2007 | 20:54:28

Главная  -  Поговорим?  -  Наука

18332

Roger


M.

16.07.2021 | 00:07:03

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Да вообще насрать на людей, они всё-равно все когда-нибудь сдохнут.
номер сообщения: 49-54-34778

18333

grizly

16.07.2021 | 01:55:08

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Roger:
Элси_Р: Проблема там в том, что если бы это действительно было правдой - все бы давно уже заболели. Поголовно. И ничего бы их не спасло.

На самом деле, главный санитарный врач Квинсленда действительно этого не заявляла. В оригинале цитата звучала так:

At the start of this pandemic, I spoke about 15 minutes of close contact being a concern. Now it looks like it’s five to 10 seconds that’s a concern.

Поскольку они отслеживают все контакты, они там видят случаи, когда заражение происходит "при мимолетном контакте". Вот, например, одна из его ссылок
What we know about the 'fleeting' spread of the COVID-19 Delta variant in Sydney

С другими вариантами такого вроде бы не было. Такое отследить можно, наверно, только в очень ограниченном числе стран, где практически нет community transmission. Это совсем не основной способ распространения, но он существует. Если они хотят добиться zero transmissions, то он возможно важен.
номер сообщения: 49-54-34779

18334

grizly

16.07.2021 | 02:27:37

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время


PS Коннектикут, кстати, был третьим по количеству смертей на единицу населения по итогам первого этапа эпидемии вслед за Нью Джерси и Нью Йорком. Немного отставал Роуд Айленд и Массачусетс. По итогам второй волны четвертым, кажется. Сейчас его обогнал список из республиканских штатов - Миссисипи, Аризона, Алабама, Луизиана по всей видимости потому, что там значительно меньший процент вакцинированных.
На подходе Южная Дакота, но с ней непонятно. Она должна была обгонять еще в зимнюю волну, но затормозилась.
номер сообщения: 49-54-34780

18335

Roger


M.

16.07.2021 | 04:17:01

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Новая статья про Спутник от аргентинцев (варианты не рассматриваются).
номер сообщения: 49-54-34781

18336

Kazus


Maryland

16.07.2021 | 04:39:06

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Обережний герой: Сейчас Россия по смертности от ковида на единицу населения наверно на первом месте в мире.


Может и будет когда-то, но не сейчас. Посмотрел на wOm:

За сегодня (по моему времени) была на 15-м месте,
за вчера была на 11-м, за позавчера на 16-м.
Тренд за всю последнюю неделю на 13-м.
номер сообщения: 49-54-34782

18337

grizly

16.07.2021 | 06:28:49

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant

We report the first local transmission of the Delta SARS-CoV-2 variant in mainland China. All 167 infections could be traced back to the first index case. The investigation on daily sequential PCR testing of the quarantined subjects indicated the viral load of the first positive test of Delta infections was ~1000 times higher than that of the 19A/19B strains infections back in the initial epidemic wave of 2020, suggesting the potential faster viral replication rate and more infectiousness of the Delta variant at the early stage of the infection.


There's been a lot of breathless news coverage about delta and it's mostly focused on increased transmissibility (and maybe pathogenicity). VOCs aren't just inherently more transmissible (or more pathogenic). There must be a mechanism that underlies increased transmission. Some hypothetical mechanisms include:

-Increased fitness (more shedding)
-Increased infectivity (better at infecting host cells ie tighter receptor binding)
-Longer period of contagion (shed virus for longer)
-Increased environmental stability (more tolerant to temp/humidity/etc)

This study attempted to address this in quarantined close contacts of confirmed cases. These people were tested daily by PCR, which allowed the investigators to determine the course of infection: longitudinal viral loads and time from exposure to positivity and symptoms. The findings are quite striking. This shows that:

-People infected with delta test positive more quickly following exposure, suggesting more rapid viral growth.
-The viral loads (by PCR Ct) are 1000 times higher in delta when first detected.

This suggests that the delta incubation period is reduced compared to the prior viruses. Also, people infected with delta are shedding a shit-ton more virus than those from earlier variants.

This certainly explains delta's increased transmissibility. If people are shedding 1000X more virus, the probability that a close contact will be exposed to an infectious dose is much higher.

If people become contagious more quickly after exposure, they can have more opportunity to infect others.
номер сообщения: 49-54-34783

18338

mickey

16.07.2021 | 07:10:57

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Roger: Да вообще насрать на людей, они всё-равно все когда-нибудь сдохнут.

Особенно на всех больных не-ковидом. Да здравствует одна болезнь, на остальные насрать!
номер сообщения: 49-54-34784

18339

Обережний герой

кмс
Харьков

16.07.2021 | 07:55:09
Сайт

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Kazus:
Обережний герой: Сейчас Россия по смертности от ковида на единицу населения наверно на первом месте в мире.


Может и будет когда-то, но не сейчас. Посмотрел на wOm:

За сегодня (по моему времени) была на 15-м месте,
за вчера была на 11-м, за позавчера на 16-м.
Тренд за всю последнюю неделю на 13-м.


Это наверно эффект маленьких выборок с их флуктуациями. В России каждый день умирает от ковида один из 200 000, так что даже один умерший в небольшой стране может позволить этой стране обогнать Россию.

__________________________
pr.ai PRAI Portal of Robotics and Artificial Intelligence
номер сообщения: 49-54-34785

18340

Roger


M.

16.07.2021 | 08:02:35

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
mickey:
Roger: Да вообще насрать на людей, они всё-равно все когда-нибудь сдохнут.

Особенно на всех больных не-ковидом. Да здравствует одна болезнь, на остальные насрать!

Нет, почему же? Вообще на всех, кроме меня, любимого.
номер сообщения: 49-54-34786

18341

grizly

16.07.2021 | 08:12:12

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Kazus:
Может и будет когда-то, но не сейчас. Посмотрел на wOm:

За сегодня (по моему времени) была на 15-м месте,
за вчера была на 11-м, за позавчера на 16-м.
Тренд за всю последнюю неделю на 13-м.


Там не для всех стран цифры оттуда имеют отношение к реальности. У некоторых слишком много смертей недосчитывают в официальных данных. Россия одна из таких стран. Для них лучше смотреть по избыточной смертности. Не все страны публикуют надежные данные по избыточной смертности тоже. Например, Индия. Для таких еще сложнее оценить сколько умирает на самом деле.
номер сообщения: 49-54-34787

18342

Roger


M.

16.07.2021 | 08:16:41

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Kazus: Тренд за всю последнюю неделю на 13-м.

Да, трендя́т они хорошо.
номер сообщения: 49-54-34788

18343

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 08:22:12

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Насрать на людей именно тем, кто всегда готов запирать, разорять, запрещать жить другим, чтобы чуть-чуть уменьшить шансы собственной досрочной смерти. Когда же к этому добавляются моральные ламентации, тут уж невольно вспоминается Порфирий Владимирович.
номер сообщения: 49-54-34789

18344

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 08:28:30

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Вот и главный бюрократ от медицины записался в конспирологи.

Пока преждевременно исключать версию о том, что коронавирус SARS-CoV-2, вызывающий болезнь COVID-19, появился в лаборатории китайского города Ухань и распространился из-за утечки, заявил глава Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) Тедрос Аданом Гебрейесус,

Похоже, закрывать глаза на реальность становится совсем трудно, как бы хорошо это ни оплачивалось.
номер сообщения: 49-54-34790

18345

Обережний герой

кмс
Харьков

16.07.2021 | 08:32:23
Сайт

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
К стыду не знаю, ни что такое ламентации, ни кто такой Порфирий Владимирович.

__________________________
pr.ai PRAI Portal of Robotics and Artificial Intelligence
номер сообщения: 49-54-34791

18346

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 08:36:03

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Вам-то чего стыдиться? Вы не обязаны знать ни русский язык, ни русскую классическую литературу.
номер сообщения: 49-54-34792

18347

Обережний герой

кмс
Харьков

16.07.2021 | 08:43:22
Сайт

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Не обязан, но всё-же. Порфирия Петровича я припоминаю. И есть украинское слово «лемент».

__________________________
pr.ai PRAI Portal of Robotics and Artificial Intelligence
номер сообщения: 49-54-34793

18348

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 08:54:36

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Порфирий Петрович - это из Достоевского. У Салтыкова-Щедрина персонаж с таким именем-отчеством тоже есть, но в нашем случае уместно припомнить именно Порфирия Владимировича.

Лемент, если доверять гугль-переводчику, это крик. Не то.
номер сообщения: 49-54-34794

18349

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 09:58:07

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Ещё о тестах.

Нельзя сравнивать доступные в настоящее время тесты на коронавирус ввиду их различной чувствительности и специфичности. Более того, даже если тест имеет специфичность от 96% до 98%, если вероятность претеста COVID-19 составляет менее 5%, более вероятно, что результат будет ложноположительным, чем истинно положительным - и это одна из ключевых причин почему массовое серологическое тестирование не рекомендуется.

Байесовские формулы выше моего разумения, так что проверим "на счётах". Допустим, мы протестировали 100000 человек, априорно известно, что примерно 4% должны быть заражены ковидом. Таким образом, имеем 96000 здоровых и 4000 заражённых. При специфичности 98% из 96000 здоровых ложноположительный тест получат 1920 человек, что меньше, чем 4000 истинно заражённых. То есть в итоге в группе получивших положительный тест заражённых будет больше, а не меньше, чем здоровых. Не сходится! И даже если специфичность 96%, "ложнозаражённых" будет 3840 человек, то есть чуть меньше, чем истинно заражённых.

Таким образом, заявление автора по цитате не подтверждается. Хотя вероятность ложноположительного результата всё-таки весьма велика, но 50% при таких условиях не достигает. Буду благодарен здешним математикам за указание на мою ошибку, если она есть.
номер сообщения: 49-54-34795

18350

mickey

16.07.2021 | 10:21:54

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Roger:
mickey:
Roger: Да вообще насрать на людей, они всё-равно все когда-нибудь сдохнут.

Особенно на всех больных не-ковидом. Да здравствует одна болезнь, на остальные насрать!

Нет, почему же? Вообще на всех, кроме меня, любимого.

Ну да, переход на личности, как же иначе .
номер сообщения: 49-54-34796

18351

Почитатель

16.07.2021 | 13:11:24

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Evgeny Gleizerov: Буду благодарен здешним математикам за указание на мою ошибку, если она есть.

Не математик, и не берусь указать. Могу только предположить, что априорная вероятность < 5% ("if the pretest probability of COVID-19 is < 5%"; неверно переведено как "вероятность претеста") означает совсем другое, нежели
априорно известно, что примерно 4% должны быть заражены ковидом
(из выборки в 100000 человек, или из любой другой)
номер сообщения: 49-54-34797

18352

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 13:36:02

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Что же ещё может означать "the pretest probability", кроме априорной вероятности для случайно взятого члена популяции оказаться заражённым ковидом?

Надо понимать, что эта априорная вероятность не может быть слишком высокой. Даже 5% означает, что каждый двадцатый в момент тестирования заражён - не переболел, а именно в данный момент заражён! Трудно себе такое представить. А чем меньше априорная вероятность, тем выше вероятность, что получивший положительный результат теста на самом деле здоров. Например, если в моём примере априорная вероятность не 4 процента, а 2 (то есть в популяции заражён примерно каждый пятидесятый, что ближе к реальности), получаем при специфичности 96% 3840 "ложнозаражённых" на 2000 заражённых. Вот тогда получается, как у автора: "более вероятно, что результат будет ложноположительным, чем истинно положительным".

Это, кстати, и к теме бесконечных сочинских тестов относится. В обычной ситуации положительный тест положено перепроверять, что резко уменьшает вероятность ошибки. А тут что толку, поезд ушёл, проигрыш уже зафиксирован. Если окажется, что тест ложноположительный, никто тебе очко не вернёт и в следующий круг не пустит.
номер сообщения: 49-54-34798

18353

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 13:53:57

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Ого! В Москве и Подмосковье отменили QR-коды для посещения заведений, разрешили фудкорты, разрешили работать по ночам! Рестораторы и их персонал - а это десятки тысяч людей - могут выдохнуть.

Честно говоря, не ожидал. Дай бог, чтобы это стало сигналом и провинциальным властям. Распространение вируса с декларируемой контагиозностью всё равно не остановить, так не надо хотя бы бессмысленно разорять людей.
номер сообщения: 49-54-34799

18354

onedrey

16.07.2021 | 14:55:01

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
QR-коды сыграли свою роль в качестве волшебного пенделя для вакцинации, и сколько-то десятков тысяч жизней спасли.

А ирония в том, что из тех, кто ломанулся из-за QR-кодов делать прививку, не сможет этими QR-кодами воспользоваться никто: если сделал первую прививку 28.06, в день введения QR-кодов, то вторую назначали на 19.07 - день их отмены.
номер сообщения: 49-54-34800

18355

Roger


M.

16.07.2021 | 17:52:05

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Evgeny Gleizerov: Что же ещё может означать "the pretest probability", кроме априорной вероятности для случайно взятого члена популяции оказаться заражённым ковидом?

Это априорная вероятность случайно взятого члена популяции дать положительный тест на ковид. Утверждение авторов как раз сводится к тому, что если 2-4% тестов здоровых людей - ложноположительные, а всего положительных тестов в популяции - меньше 5%, то большая часть из них может оказаться ложными. Утверждение вполне корректное.

Но теперь на всякий случай обратите внимание на год в статье. С тех пор многое поменялось, например специфичность на тестах Thermo Fischer с последними версиями софта >99%, отдельные фрики догоняют до 100.
номер сообщения: 49-54-34801

18356

Элси_Р

нет
Москва

16.07.2021 | 18:08:18

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Китайские исследования показывают резкое увеличение вирусной нагрузки от дельты, а трансмиссивность — самая высокая среди всех существующих вариантов. Концентрация вирусного аэрозоля в выдохе заражённого крайне высокая — и это, по словам китайских специалистов, требует пересмотра прежних подходов к выявлению случаев и изолированию контактных. Теперь каждый, кто был в помещении или здании, которое посещал инфицированный дельтой даже за несколько дней, должен расцениваться как тесный контакт.


__________________________
Снова бьются стекла...
номер сообщения: 49-54-34802

18357

onedrey

16.07.2021 | 18:20:54

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
А в Туве ввели жесткий локдаун
номер сообщения: 49-54-34803

18358

Элси_Р

нет
Москва

16.07.2021 | 18:33:12

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
onedrey: А в Туве ввели жесткий локдаун

По данным Управления Роспотребнадзора по РТ, с 14 июня на протяжении 5 недель в республике продолжается значительный прирост заболеваемости COVID-19, недельные темпы прироста сохраняются стабильно высокими и составляют от 28,6% до 66,0%. При этом рост заболеваемости регистрируется во всех возрастных группах, в том числе среди детей до 17 лет в 5,8 раза, лиц 18-29 лет – в 8,7 раза, лиц 30 – 49 лет в 10,2 раза, лиц 50-64 лет в 9,7 раза, лиц старше 65 лет – в 9,4 раза.

По-моему это чушь с точки зрения математики...

__________________________
Снова бьются стекла...
номер сообщения: 49-54-34804

18359

onedrey

16.07.2021 | 18:40:14

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
5,8 раз - это 42% в неделю, 10,2 раза - это 59% в неделю. Всё там нормально с точки зрения математики
номер сообщения: 49-54-34805

18360

Элси_Р

нет
Москва

16.07.2021 | 18:44:27

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
onedrey: 5,8 раз - это 42% в неделю, 10,2 раза - это 59% в неделю. Всё там нормально с точки зрения математики

...от 28,6% до 66,0%

__________________________
Снова бьются стекла...
номер сообщения: 49-54-34806

18361

Evgeny Gleizerov

16.07.2021 | 18:50:04

все его сообщения:
за день, за месяц,
за все время
Roger:
Evgeny Gleizerov: Что же ещё может означать "the pretest probability", кроме априорной вероятности для случайно взятого члена популяции оказаться заражённым ковидом?

Это априорная вероятность случайно взятого члена популяции дать положительный тест на ковид. Утверждение авторов как раз сводится к тому, что если 2-4% тестов здоровых людей - ложноположительные, а всего положительных тестов в популяции - меньше 5%, то большая часть из них может оказаться ложными. Утверждение вполне корректное.

Ах, вот оно что. Благодарю за разъяснение. Тем не менее, если можно сделать хотя бы грубую оценку общего числа заражённых ковидом в данной популяции на момент взятия теста, можно и посчитать байесовскую вероятность того, что получивший положительный тест заражён/здоров. Любопытно, занимался ли этим кто-нибудь. Как я понимаю, и при 99-процентной специфичности могут быть интуитивно парадоксальные результаты.
номер сообщения: 49-54-34807