|
|
|
|
|
|
|
|
| |
|
|
|
|
|
|
|
Roger: | Results: Of the 7,389 samples, 106 were reactive by pan Ig. Of these 106 specimens, 90 were available for further testing. Eighty four of 90 had neutralizing activity, 1 had S1 binding activity, and 1 had receptor binding domain / Ace2 blocking activity >50%, suggesting the presence of anti-SARS-CoV-2-reactive antibodies. |
Для теста, в котором были отобраны эти 106 образцов
| specificity of this assay is 99.3% (confidence interval 98.32 – 99.88%) |
То есть число ложнопозитивных должно быть в районе 10..125. Подавляющее большинство таковыми и являются, что следует хотя бы из того, что число положительных варьируется для разных штатов и дат в пределах погрешности.
Реально речь идёт максимум об 1-2 случаях, которые могли приехать уже в виде антител.
Вообще, для этого исследования явно не хватает большой контрольной серии образцов из доковидного прошлого, вслепую добавленной к остальным. |
Насколько я понял confirmatory assay было вторым тестом и эти 106 прошли через оба теста. Т.е среди 106 может быть лишь 1-2 ложнопозитивных.
| Of these, 106 (1.4%) were confirmed reactive by the pan-Ig S ELISA screen and then a confirmatory assay with background correction |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30714 |
|
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30715 |
|
|
|
|
Может попробовать сыграть в мини-рапидтурнире в супермаске для прикола.
Могу попасть в шахматную историю.
__________________________
pr.ai PRAI Portal of Robotics and Artificial Intelligence |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30716 |
|
|
|
|
grizly: Насколько я понял confirmatory assay было вторым тестом и эти 106 прошли через оба теста. Т.е среди 106 может быть лишь 1-2 ложнопозитивных.
| Of these, 106 (1.4%) were confirmed reactive by the pan-Ig S ELISA screen and then a confirmatory assay with background correction |
|
Как я понял, 106 - это то, что осталось уже после background correction, и суммарная специфичность теста была дана выше. Она определяется тем, что антитела на другие коронавирусы могут реагировать на белки SARS-CoV-2, а дальше они уже пытались определить более точно.
| Of the 90 sera tested by microneutralization, 84 had an endpoint titer >40. When the anti-spike protein isotype responses were examined, 39 of the 90 had both S-reactive IgG and IgM (43.3%), 8 were IgM positive, but IgG negative, 29 were IgG positive but IgM negative, and the remaining 14 were just positive using a pan-Ig secondary. By the Ortho S1 pan Ig assay, one reactive serum had a signal to threshold cutoff of 1.89 (with a retest of 1.10), and by surrogate neutralization, 21 sera exhibited 20-30% inhibition, 1 at 45% inhibition, and 1 at 71% inhibition. When results in all tests were compared by individual specimen, there was not an obvious pattern of specimens with higher signals in ELISA, surrogate neutralization or live virus microneutralization tests clustering together (Figure 1), indicating that each donation had a unique pattern of test results. These data might indicate that there is no clear delineation between potentially cross reactive specimens, and those that were obviously from SARS CoV-2 infected individuals. |
Единственный образец, который имел антитела на ortho S1 был не из тех, что давали наиболее сильный отклик суррогатной нейтрализации.
Я бы сказал, что без полноценного контрольного исследования вопросы однозначно не разрешены. Контрольная группа там была, но маленькая, и в ней (ложно)положительных было 3/500, что не противоречит 100/7000. Мне кажется, надо было взять существенно больше образцов, и желательно из какой-то зимне-весенней партии крови, чтобы исключить ослабление антител на обычные коронавирусы.
Я допускаю, что отдельные образцы с антителами, реагирующими на SARS-CoV-2 могут объясняться какими-то контактами людей с зоотоническими коронавирусами, которые содержали близкие белки, но не распространялись так хорошо среди людей, то есть природа не просто держит фабрику мутаций, но и тестирует её время от времени на премиум-аудитории.
Вообще, я от нескольких людей в России слышал про сильную пневмонию в районе сентября 2019 г, и жаль, что нет хороших исследований на эту тему, а есть либо единичные сомнительные случаи (типа как в этой работе), либо итальянские 10%. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30718 |
|
|
|
|
| onedrey: - Таскали еду домой, там её и грызли; |
...там её и гризли |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30719 |
|
|
|
|
Google рекомендует заменить на «демоническими». Возможно, это синоним. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30720 |
|
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30721 |
|
|
|
|
| Судя по тексту, это были настоящие люди, которым посчастливилось прекрасно прожить жизнь и ещё лучше умереть - в один день, как в сказке. А вот сам текст сочинял (а, скорее, редактировал) обычный унылый выродок, которому хоть в лоб, хоть по лбу - "People should be worried". Хрен вам, суки, не дождётесь. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30722 |
|
|
|
|
| Это их дочь, сука, сказала |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30723 |
|
|
|
|
| Roger: Как я понял, 106 - это то, что осталось уже после background correction, и суммарная специфичность теста была дана выше. Она определяется тем, что антитела на другие коронавирусы могут реагировать на белки SARS-CoV-2, а дальше они уже пытались определить более точно. |
Только у первого теста специфичность в 99.06% оценивается
| Therefore, the specificity of the COVID-19 ELISA pan-Ig Antibody Test is 99.06% |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30724 |
|
|
|
|
Roger: | onedrey: - Таскали еду домой, там её и грызли; |
...там её и гризли |
Если бы в год гризли, то гризли, а в год крысы никого не отстреляли и мало загризли. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30725 |
|
|
|
|
| Roger:Я допускаю, что отдельные образцы с антителами, реагирующими на SARS-CoV-2 могут объясняться какими-то контактами людей с зоотоническими коронавирусами, которые содержали близкие белки, но не распространялись так хорошо среди людей, то есть природа не просто держит фабрику мутаций, но и тестирует её время от времени на премиум-аудитории. |
Ну да, я тоже думаю, что не обязательно они должны были быть от SASR-Cov-2, а остались от каких-то инфекций кошачьего происхождения. Вообще, без найденной РНК наверно не получится что-либо однозначно подтвердить.
| Roger:Вообще, я от нескольких людей в России слышал про сильную пневмонию в районе сентября 2019 г, и жаль, что нет хороших исследований на эту тему, а есть либо единичные сомнительные случаи (типа как в этой работе), либо итальянские 10%. |
Я здесь когда-то давал ссылку на сообщение о ПЦР тестах в Украине, когда эпидемия (предположительно та же) дошла уже из Сибири до Украины в январе. По всей видимости был вариант гриппа, эпидемия которого была в США в сезоне 2017/2018 годов. Но много образцов осталось неидентифицированными.
А о российских ПЦР тестах я тогда не нашел. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30726 |
|
|
|
|
В обход губернаторов
WH task force tells health officials to take matters into their own hands if state and local Covid-19 rules are too lax
CNN has obtained weekly reports from dozens of states that warn the US is "in a very dangerous place" in the pandemic as the nation sees record-high daily death counts and hospitalizations with the fear of additional surge after the Thanksgiving holiday.
That fear is so great that the task force this week has told public health officials to take matters into their own hands if policies aren't stringent enough to match the moment.
"If state and local policies do not reflect the seriousness of the current situation, all public health officials must alert the state population directly," reports sent to each state dated November 29 said.
"The COVID risk to all Americans is at a historic high... We are in a very dangerous place due to the current, extremely high COVID baseline and limited hospital capacity; a further post-Thanksgiving surge will compromise COVID patient care, as well as medical care overall." |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30727 |
|
|
|
|
California governor introduces new stay-at-home order amid Covid surge
The order, which will be applied by region, will require bars, wineries, hair salons and other nonessential businesses across five areas to close for three weeks once a region's intensive care capacity falls below 15 percent, Newsom said.
Statewide travel will also be temporarily halted, but schools will remain open, and he encouraged people to visit parks and exercise. Restaurants can continue to serve takeout and delivery, while retail shops can operate at 20 percent capacity. |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30729 |
|
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30731 |
|
|
|
|
Это, конечно, показательно. Британское правительство утвердило очередность программы вакцинирования (добровольной естественно). Начнут с пациентов домов престарелых и с самых пожилых
Первая российская вакцина для простоты вообще не тестировалась на людях старше 65 и соответственно им не положена. О планах закупки иностранных вакцин для пожилых тоже не сообщалось
В Великобритании вакцина нужна для спасения жизней, в России - для понтов. Поэтому Путин приказал в авральном порядке вакцинировать, когда на Западе начали приступать, а у нас еще испытания не закончились. Несмотря на то, что даже Голодец осмелилась возражать. Жалкий.
This priority list is as follows:
residents in a care home for older adults and their carers
all those 80 years of age and over and frontline health and social care workers
all those 75 years of age and over
all those 70 years of age and over and clinically extremely vulnerable individuals
all those 65 years of age and over
all individuals aged 16 years to 64 years with underlying health conditions which put them at higher risk of serious disease and mortality
all those 60 years of age and over
all those 55 years of age and over
all those 50 years of age and over |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30732 |
|
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30736 |
|
|
|
|
Смерти в Швеции. Красным - внесенные в статистику на этой неделе (386, на 40% больше, чем внесено на прошлой неделе, но большинство внесенных в статистику умерли в предыдущие недели, как обычно). Скорее всего, сейчас в среднем умирает уже 80+ в день.
Хотя на конец ноября они посчитали R 1,00-1,02 с вероятностью 0,95
 |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30742 |
|
|
|
|
grizly: | Roger: Как я понял, 106 - это то, что осталось уже после background correction, и суммарная специфичность теста была дана выше. Она определяется тем, что антитела на другие коронавирусы могут реагировать на белки SARS-CoV-2, а дальше они уже пытались определить более точно. |
Только у первого теста специфичность в 99.06% оценивается
| Therefore, the specificity of the COVID-19 ELISA pan-Ig Antibody Test is 99.06% |
|
И первый, и второй тесты одинаковые, делались на одном и том же оборудовании, с одними и теми же реактивами, просто в первом отсеивались заведомо отрицательные результаты, а во втором прозрачность измерялась более точно, с учётом фона (видимо, прозрачности пробирки с нанесённым белком до теста). 99.3% - это их оценка специфичности после второго теста по контрольной группе, а после этого были ещё другие тесты.
В бумаге от ФДА такие детали не расписаны, но там протоколы немного отличаются - во-первых, они тоже делали два измерения - реакция на два белка измерялась последовательно (в исследовании - одновременно), а во-вторых, пороги оптической плотности отличались, а про фон ничего не написано (но при той точности порогов скорее всего он учитывался во всех измерениях), поэтому напрямую специфичность сравнивать нельзя.
99.06% - это смешная в своей точности цифра, полученная делением 317 на 320, реально это может быть и 98, и 99.5. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30743 |
|
|
|
|
| onedrey: Первая российская вакцина для простоты вообще не тестировалась на людях старше 65 и соответственно им не положена. |
В третьей фазе вроде тестируется. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30747 |
|
|
|
|
Нашел новости только про векторовскую для 60+
Всех 150 добровольцев старше 60 лет, участвующих в пострегистрационных испытаниях вакцины от коронавируса «Эпиваккорона» центра «Вектор», привьют до конца этого года, сообщили в Роспотребнадзоре.
«По состоянию на 02.12.2020 привито 74 добровольца. Все 150 добровольцев будут привиты до конца 2020 года», — говорится в сообщении |
150, кажется, маловато. Но у них вообще мало для третьей стадии, по сравнению с конкурентами
В настоящее время клинические исследования вакцины «ЭпиВакКорона» завершены, проводятся два пострегистрационных клинических исследования: клиническое исследование с участием 150 человек старше 60 лет (в соответствии с разрешением Министерства здравоохранения РФ № 639 от 16 ноября 2020 г.) и многоцентровое клиническое исследование с участием 3000 добровольцев (в соответствии с разрешением Министерства здравоохранения РФ № 639 от 18 ноября 2020 г.).
Пострегистрационные исследования вакцины «ЭпиВакКорона» будут продолжаться шесть месяцев после вакцинации последнего участника.
В целях скорейшего старта пострегистрационных исследований эффективности вакцины «ЭпиВакКорона» было принято решение начать с ограниченной выборки, состоящей из 3000 добровольцев. 2250 добровольцев получат вакцину, 750 – плацебо. Вопрос о наборе дополнительных добровольцев для расширения исследований будет рассматриваться с учетом полученных результатов. |
АПД. Для Гамалеи
| The trial subjects will be randomized into five age strata: 18-30, 31-40, 41-50, 51-60, and 60+ years. |
Был неправ. А прививать их пока не будут (вне испытаний), по-видимому, потому, что испытания не закончились и риски велики. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30749 |
|
|
|
|
Tom Farley, former president of the New York Stock Exchange, on Friday detailed his battle with Covid-19 early in the pandemic, telling CNBC "it was not a good period in my life."
"I had a 102 to 103.5 [degree] fever for 15 days straight, and then I couldn't get out of bed for another week. I lost about 25 pounds," Farley, who is in his mid-40s |
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30751 |
|
|
|
|
| Зокрема, Степанов заявив, що Україна домовилася з компанією Pfizer. Поставка вакцини компанії очікується також на початку другого кварталу. |
Мда, это как раз лето будет начинаться. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30754 |
|
|
|
|
Вот это поворот!
Вице-премьер Татьяна Голикова дала рекомендации тем, кто планирует привиться от коронавируса. Об этом сообщает «Московский комсомолец».
Голикова попросила россиян не употреблять алкоголь 42 дня, поскольку именно столько занимает процесс формирования иммунитета. Об этом сообщает "Рамблер". |
Где ж они столько трезвенников возьмут, чтоб стадный иммунитет сформировать?
С другой стороны, если нужна будет справочка, то можно и привиться. И немедленно выпить, за здоровье. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30756 |
|
|
|
|
Только название статьи ОЧЕНЬ неправильное - 42 дня не «перед» а «после» вакцинации.
А лучше и до и после...
«вместо слов съедобные грибы следовало читать ядовитые грибы» (с) |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30757 |
|
|
|
|
Roger:
И первый, и второй тесты одинаковые, делались на одном и том же оборудовании, с одними и теми же реактивами, просто в первом отсеивались заведомо отрицательные результаты, а во втором прозрачность измерялась более точно, с учётом фона (видимо, прозрачности пробирки с нанесённым белком до теста). 99.3% - это их оценка специфичности после второго теста по контрольной группе, а после этого были ещё другие тесты. |
Ну то есть, в первом тесте два измерения (хотя здесь может и одно) и во втором тесте два измерения. Первый тест - это быстрый prescreening без background correction. Он что-то отсеял, сколько не знаем. Специфичность его мы тоже не знаем, ну я бы предположил, глядя на достаточные высокие цифры и FDA и контрольной группы, что уж больше 90% (даже если одно измерение, то все равно какая-то достаточно высокая цифра)
Второй тест уже с background correction на оставшився образцах и с контрольной группой, по которой знаем специфичность. После второго осталось 106 образцов.
То есть, как я понимаю, специфичность прескринингa+второго теста должна быть значительно выше, чем второго теста самого по себе. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30759 |
|
|
|
|
| Ровно одинаковая, прескрининг нужен только для скорости. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30760 |
|
|
|
|
| Одинаковая, это только если систематический фактор предполагать и никакой случайности. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30761 |
|
|
|
|
Так там и есть случайность, в первом тесте разброс сильнее из-за фона. Поэтому, чтобы не ухудшилась чувствительность, порог на прескрининге занижен так, что в общую специфичность он никакого вклада не вносит.
То есть вариант, когда гипотетический ложный образец, не прошедший прескрининг, мог бы пройти второй тест, практически невероятен. |
|
|
| номер сообщения: 49-54-30762 |
|
|
|
|
| номер сообщения: 49-54-30763 |
|
|
| |
|
|
|
|
|
|
|
| Copyright chesspro.ru 2004-2024 гг. |
|
|
|
